42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1193 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  100 
 
 		 421 aa  840    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  72.86 
 
 		 419 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  68.97 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  68.74 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  50 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  46.27 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  44.09 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  42.14 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  42.78 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  42.36 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  43.11 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  41.28 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  40.81 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  42.36 
 
 		 428 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  41.69 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  40.8 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  41.87 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  40.8 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  40.28 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  40.8 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  40.8 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  40.8 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  39.53 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  39.3 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.52 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  35.51 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  35.51 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  32.38 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  37.12 
 
 		 452 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  33.33 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  33.1 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  31.73 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  32.86 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  34.62 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  33.96 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  32.2 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  36.11 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  31.45 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  32.17 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.51 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.29 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  19.9 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>