267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1114 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  531  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  61.15 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  54.44 
 
 
258 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  38.75 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  40.32 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  34.68 
 
 
242 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  37.6 
 
 
238 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  36.73 
 
 
222 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  32.75 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  33.19 
 
 
222 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  32.46 
 
 
222 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  30.71 
 
 
238 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.36 
 
 
244 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.75 
 
 
246 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.75 
 
 
246 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  33.05 
 
 
242 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  33.05 
 
 
242 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.34 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  30.97 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  32.6 
 
 
221 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  29.87 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  30.49 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  30.93 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  30.93 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.91 
 
 
243 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  33.19 
 
 
247 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  34.31 
 
 
245 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.46 
 
 
224 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.53 
 
 
243 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.32 
 
 
238 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  32.62 
 
 
237 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  27.91 
 
 
254 aa  105  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  29.72 
 
 
233 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.17 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  29.52 
 
 
237 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  26.34 
 
 
223 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  32.29 
 
 
227 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.29 
 
 
227 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 
223 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  28.91 
 
 
238 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.07 
 
 
243 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  28.31 
 
 
224 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  30.08 
 
 
292 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.51 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  30.08 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  27.73 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  29.57 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.17 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.63 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  31.09 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.64 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  27.97 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.53 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  27.09 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  27.43 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  27.73 
 
 
235 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  36.97 
 
 
141 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  27.43 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  27.71 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  30.26 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.3 
 
 
218 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  28.7 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  28.11 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  27.1 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.29 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  27.31 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  27.62 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  32.19 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.26 
 
 
234 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  30.25 
 
 
236 aa  92.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.72 
 
 
240 aa  92  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.21 
 
 
262 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.7 
 
 
316 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.96 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.51 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.7 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  25.5 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.7 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.7 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  28.21 
 
 
239 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29.21 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.81 
 
 
300 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30.58 
 
 
308 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.51 
 
 
300 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  27.51 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  26.43 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.34 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.71 
 
 
285 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.01 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>