158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1084 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  933    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  37.36 
 
 
437 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  37.59 
 
 
437 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  37.59 
 
 
437 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
437 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
437 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  36.93 
 
 
437 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  36.7 
 
 
437 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  36.81 
 
 
437 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  36.81 
 
 
438 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  36.95 
 
 
434 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.01 
 
 
437 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  34.11 
 
 
439 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  34.35 
 
 
445 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  33.02 
 
 
428 aa  247  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  35.94 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  31.24 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  31.72 
 
 
434 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  33.02 
 
 
437 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  33.87 
 
 
452 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  33.72 
 
 
470 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.49 
 
 
436 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  35.12 
 
 
437 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  34.42 
 
 
437 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  32.71 
 
 
425 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
433 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  31.89 
 
 
473 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  32.63 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.11 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  31.19 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  31.49 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.72 
 
 
447 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  28.95 
 
 
486 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  29.88 
 
 
427 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  31.4 
 
 
464 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  32.19 
 
 
424 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.75 
 
 
412 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  32.33 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  32 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  30.36 
 
 
475 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  29.98 
 
 
469 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  31.09 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  29.81 
 
 
429 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  31.6 
 
 
440 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.2 
 
 
411 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.6 
 
 
423 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28.84 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  29.7 
 
 
415 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  28.37 
 
 
415 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  28.96 
 
 
439 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  30.43 
 
 
466 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.97 
 
 
478 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
448 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.83 
 
 
449 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.82 
 
 
429 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  26.05 
 
 
418 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  25.4 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.27 
 
 
417 aa  99.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  24.35 
 
 
574 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  28.07 
 
 
556 aa  97.4  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  29.46 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  23.79 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  26.82 
 
 
572 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.47 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  32.57 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  23.11 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  21.51 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  22.76 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.37 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  24.91 
 
 
246 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  28.72 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.63 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.6 
 
 
761 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 
366 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  18.56 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.28 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  28.49 
 
 
558 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  19.59 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  19.82 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 
483 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  28.26 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  18.1 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  18.1 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  18.1 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.13 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  18.1 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  27 
 
 
584 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
463 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.65 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  26.18 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>