More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1062 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
308 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.43 
 
 
292 aa  421  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.14 
 
 
285 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  54.39 
 
 
286 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  55.31 
 
 
286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  53.11 
 
 
286 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2146  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  53.68 
 
 
286 aa  325  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  52.75 
 
 
286 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  52.38 
 
 
285 aa  321  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.93 
 
 
285 aa  315  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.79 
 
 
287 aa  311  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.88 
 
 
285 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  50.88 
 
 
285 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  50.88 
 
 
285 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  50.88 
 
 
285 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.43 
 
 
287 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
287 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
287 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
287 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
287 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.07 
 
 
287 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.66 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  51.66 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.93 
 
 
286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  51.88 
 
 
277 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3671  polyamine ABC transporter, permease protein  48.41 
 
 
292 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  49.47 
 
 
284 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.04 
 
 
283 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1147  hypothetical protein  44.95 
 
 
282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1142  hypothetical protein  44.63 
 
 
282 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  45.9 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  45.9 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
282 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
282 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.9 
 
 
282 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.9 
 
 
282 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  45.9 
 
 
282 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  45.9 
 
 
282 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.9 
 
 
282 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
281 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
282 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
295 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 
291 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
278 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
293 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  39.65 
 
 
297 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  39.3 
 
 
297 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  40.3 
 
 
281 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  39.93 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  46.61 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  45.7 
 
 
303 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  40.33 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
304 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
301 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
301 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
299 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
301 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.33 
 
 
330 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
301 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1647  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.44 
 
 
321 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.16764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.5 
 
 
319 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
295 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
301 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1694  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.74 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.35 
 
 
299 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
301 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
301 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4398  putrescine ABC transporter subunit inner membrane protein  40.22 
 
 
338 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.271562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.41 
 
 
319 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
275 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
302 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
301 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
299 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
301 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00861  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2475  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.34 
 
 
317 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0884  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.994731  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.02 
 
 
306 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2740  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0654072  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0959  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00867  hypothetical protein  39.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
317 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0928  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
317 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
323 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
323 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>