More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1013 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  76.92 
 
 		 249 aa  400  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  77.33 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  62.1 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  62.9 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  61.85 
 
 		 248 aa  294  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  59.84 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  61.69 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  60.64 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  60.24 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  59.44 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  59.2 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  60.48 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  61.29 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  287  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  60.89 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  57.6 
 
 		 249 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  57.03 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  60.08 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  58.47 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  60.66 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  60.25 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  58.47 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  58.47 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  58.47 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  57.83 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  58.06 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  59.04 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  59.04 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  59.27 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  58.63 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  57.26 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  57.26 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  57.26 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  57.26 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  56.85 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  54.47 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  56.73 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  56.73 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  56.45 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  53.01 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  55.82 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  60.24 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  54.66 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  54.66 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  53.04 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  58.54 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  52.92 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  52.92 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  58.06 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  55.51 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  53.33 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.44 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  52.74 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  52.46 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  52.32 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  51.42 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.18 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  50.4 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  56.12 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  56.12 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  56.12 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.79 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  52.52 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  55.7 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  55.7 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  52.5 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  55.7 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  54.32 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  55.27 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.01 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  55.27 
 
 		 242 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  55.27 
 
 		 242 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>