More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0955 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 201 aa  421  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  72.31 
 
 		 203 aa  296  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  70.26 
 
 		 203 aa  292  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  64.37 
 
 		 181 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  64.37 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  66.08 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  63.43 
 
 		 181 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  59.66 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  62.86 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  62.64 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  62.86 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 		 181 aa  237  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.35 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  61.99 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  63.43 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  63.43 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  63.79 
 
 		 190 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  59.54 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 		 186 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 		 186 aa  227  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 187 aa  227  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  60.47 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  62.64 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 		 189 aa  225  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  59.66 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  59.3 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  57.56 
 
 		 182 aa  222  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  58.48 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  53.09 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  59.06 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  59.3 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  56.4 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  58.48 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  58.93 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  58.48 
 
 		 186 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  57.4 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  56.07 
 
 		 235 aa  210  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  52.27 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  56.55 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  52.27 
 
 		 188 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  56.55 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 213 aa  207  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  55.75 
 
 		 193 aa  204  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  54.91 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 235 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  53.22 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  48.89 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  54.39 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  52.98 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  51.19 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  51.18 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  48.24 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  50.86 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  50 
 
 		 270 aa  194  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  50.56 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  50.88 
 
 		 186 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  50.9 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  45.36 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  49.71 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  51.19 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  51.19 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  53.99 
 
 		 435 aa  189  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  52.35 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  52.05 
 
 		 329 aa  187  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 223 aa  187  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  51.18 
 
 		 194 aa  184  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  46.33 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  49.42 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  48.62 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  49.7 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  49.43 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  50.3 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  50.3 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  50.3 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.3 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  50.87 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  48.54 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  49.11 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  50.59 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  50.59 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  50.59 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  50.59 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  50.59 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>