More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0902 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
399 aa  827    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 
396 aa  362  8e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
401 aa  346  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 
393 aa  345  6e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  40.86 
 
 
397 aa  329  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  40 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  45.55 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  44.05 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  42.53 
 
 
393 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
388 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  41.49 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  41.75 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.46 
 
 
398 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  42.27 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  42.27 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  41.75 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 
398 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  43.29 
 
 
396 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  43.29 
 
 
396 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
398 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
392 aa  316  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
395 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  41.81 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.49 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
391 aa  305  7e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  40.36 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.39 
 
 
394 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  42.64 
 
 
399 aa  300  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
395 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
397 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
383 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 
395 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  42.24 
 
 
406 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 
397 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.4 
 
 
397 aa  289  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
403 aa  288  8e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 
395 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
405 aa  282  9e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
406 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.11 
 
 
406 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 
398 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  37.12 
 
 
399 aa  272  9e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.2 
 
 
420 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
426 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 
400 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 
426 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 
398 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
414 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  36.93 
 
 
397 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  36.22 
 
 
390 aa  269  8e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
398 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 
395 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 
402 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
411 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
397 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
411 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
395 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 
416 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
396 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
399 aa  262  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  37.28 
 
 
402 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 
405 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
411 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 
430 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
413 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
409 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
393 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  35.7 
 
 
411 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 
394 aa  256  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
426 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
399 aa  255  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.92 
 
 
436 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  36.39 
 
 
408 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  36.39 
 
 
408 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
386 aa  253  6e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.52 
 
 
433 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  35.91 
 
 
404 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>