158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0846 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  44.38 
 
 
184 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  44.38 
 
 
184 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  44.38 
 
 
184 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  44.38 
 
 
184 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  50 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  43.75 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  43.75 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  43.12 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  43.12 
 
 
184 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  38.46 
 
 
173 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  41.22 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  50.46 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  44.52 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.54 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  49.56 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  44.52 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  44.52 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  34.91 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  42.18 
 
 
159 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  39.29 
 
 
178 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  42.18 
 
 
159 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 
325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  36.75 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  42.86 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  38.22 
 
 
189 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  44.35 
 
 
120 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  32.4 
 
 
179 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  35.23 
 
 
188 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  35.22 
 
 
323 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  40.29 
 
 
157 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  35.26 
 
 
183 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  32.97 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  34.97 
 
 
167 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  34.39 
 
 
189 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  39.74 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  42.96 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  38.06 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  37.84 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  35.19 
 
 
169 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  35.15 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  33.15 
 
 
324 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  38.51 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  37.42 
 
 
178 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.67 
 
 
164 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.64 
 
 
368 aa  94.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  39.07 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  35.95 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  39.13 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  35.8 
 
 
394 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  36.76 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  37.66 
 
 
301 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  39.86 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  37.18 
 
 
392 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  33.15 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  36.99 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
390 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  28.96 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  40.16 
 
 
185 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  34.11 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20090  CBS-domain-containing membrane protein  32.89 
 
 
173 aa  85.1  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  36.36 
 
 
378 aa  85.1  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  27.98 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
387 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  35.86 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  34.39 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.77 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  30.22 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  30.22 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.77 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.77 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  35.38 
 
 
391 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  30.22 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  35.15 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  29.67 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 
376 aa  81.3  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  35.82 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.62 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  30.27 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  34.59 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  30.22 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  33.61 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  33.78 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  33.33 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  37.06 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  37.1 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  35.85 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  34.96 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  29.73 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  29.73 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
391 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>