46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0839 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  46.27 
 
 
140 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  43.85 
 
 
130 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  45.8 
 
 
136 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  44.44 
 
 
137 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  44 
 
 
130 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  41.27 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  44.92 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  42.5 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  45.38 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  43.44 
 
 
135 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  40.65 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  46.72 
 
 
136 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  40.65 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  39.69 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  44 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  41.27 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  40.62 
 
 
136 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  39.68 
 
 
131 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  41.32 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  42.34 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  37.12 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  40.31 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  40.31 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  40.31 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  40.31 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  37.25 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  34.53 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  41.41 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  38.4 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  39.53 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  37.9 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  38.4 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  40.71 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  36.62 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  40.62 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  41.6 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  34.13 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  34.06 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  37.5 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  35.2 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  34.65 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  35.96 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  36.29 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  33.61 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  30.65 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>