More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0745 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  100 
 
 		 407 aa  845    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  52.69 
 
 		 368 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  50.14 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  48.44 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  47.35 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  41.71 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  37.75 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  37.46 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  33.62 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.25 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  32.79 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  30.75 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.92 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.94 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  29.92 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  28.99 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.22 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  28.85 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.94 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  28.94 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  26.78 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.39 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  26.3 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  29.44 
 
 		 367 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.43 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.48 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  26 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  24.41 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  28.05 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 478 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  29.01 
 
 		 689 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  22.47 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.59 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.67 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.07 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  24.67 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.64 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  27.63 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.16 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.63 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.87 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>