More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0690 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
419 aa  860    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  49.16 
 
 
419 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.75 
 
 
419 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
438 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
438 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.83 
 
 
464 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.32 
 
 
443 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  28.74 
 
 
444 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.69 
 
 
445 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.87 
 
 
446 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.09 
 
 
442 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.22 
 
 
446 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  26.1 
 
 
434 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  26.37 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.32 
 
 
445 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  27.23 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  22.56 
 
 
441 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  28.94 
 
 
443 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  27.39 
 
 
489 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  27.9 
 
 
447 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  27.17 
 
 
447 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.07 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  27.07 
 
 
447 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
446 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.67 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  24.45 
 
 
424 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.73 
 
 
421 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
443 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  25.35 
 
 
438 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.78 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.18 
 
 
421 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  26.85 
 
 
445 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  22.48 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  23.8 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  25.58 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.9 
 
 
430 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  24.32 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.69 
 
 
447 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.72 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.2 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.58 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  23.15 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.55 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  21.83 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  21.83 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  22.99 
 
 
496 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.77 
 
 
456 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.81 
 
 
676 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  40.82 
 
 
307 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.34 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  23.26 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4089  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.12 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  27.83 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  26.5 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  23.83 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  22.89 
 
 
585 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.11 
 
 
336 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  26.73 
 
 
323 aa  59.7  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.78 
 
 
254 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4554  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.77 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.16 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0490  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  37.65 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  25.22 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  23.58 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.11 
 
 
688 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.11 
 
 
677 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  22.04 
 
 
481 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  24.62 
 
 
316 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54409  ferric reductase  30.19 
 
 
746 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.11 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.19 
 
 
681 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  23.04 
 
 
339 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.86 
 
 
465 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  23.98 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.21 
 
 
232 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.69 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  21.24 
 
 
481 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  22.73 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  25.5 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  25.12 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54982  ferric reductase  27.93 
 
 
746 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1748  ferredoxin  23.56 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.31 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.31 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  22.08 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.43 
 
 
669 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.23 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.47 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  25 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  25.16 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  23.76 
 
 
316 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.29 
 
 
232 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0437  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  37.35 
 
 
281 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0284917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>