More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0658 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  69.02 
 
 
256 aa  364  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  244  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  45.2 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  46 
 
 
252 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  45.38 
 
 
252 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  46.99 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
252 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
252 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  45.61 
 
 
252 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
252 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  42.32 
 
 
252 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  44.67 
 
 
252 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
252 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  44.58 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  45.49 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  42.21 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 
252 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
252 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  43.44 
 
 
252 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  41.8 
 
 
251 aa  215  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
253 aa  215  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  45.06 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  42.55 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  40.96 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  44.78 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  42.15 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  42.15 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
252 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  40.16 
 
 
252 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
251 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
252 aa  208  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  41.67 
 
 
253 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  45.64 
 
 
260 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
251 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  45.64 
 
 
260 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  42.74 
 
 
251 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
252 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  45.23 
 
 
260 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
250 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
250 aa  198  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
250 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  41 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  38.96 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.18 
 
 
251 aa  195  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  40.16 
 
 
250 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  42.39 
 
 
253 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  38.15 
 
 
250 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  39.09 
 
 
269 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.48 
 
 
259 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  33.33 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.43 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.07 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
258 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
263 aa  181  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  36.86 
 
 
266 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  39.75 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  36.8 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 
265 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  36.36 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  40.91 
 
 
265 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
286 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
255 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  37.5 
 
 
255 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  35.8 
 
 
258 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
265 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
265 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
256 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  37.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1050  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
263 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
265 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  37.92 
 
 
255 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
265 aa  174  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  38.43 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1392  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00709289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.3 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  34.78 
 
 
273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  38.27 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  38.17 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>