96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0652 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  994    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  51.91 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  41.48 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  31.9 
 
 		 372 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  31.53 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  30.61 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  28.99 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  29.36 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  25.63 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.08 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  34.27 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  29.02 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 384 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 387 aa  90.5  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  28.95 
 
 		 402 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  30.95 
 
 		 362 aa  87.4  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  29.73 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  27.32 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  26.99 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  28.81 
 
 		 405 aa  76.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.57 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  27.57 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.27 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 379 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  24.6 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  23.6 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  26.54 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  25.31 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  20.34 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  29.09 
 
 		 390 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  22.53 
 
 		 386 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  21.63 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  21.31 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  27.56 
 
 		 390 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.78 
 
 		 379 aa  50.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  19.8 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  21.14 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  21.67 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 384 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 382 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.47 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  18.31 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  30.38 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  22.16 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  22.4 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  22.4 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.27 
 
 		 369 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 378 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  18.98 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.66 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 382 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>