292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0631 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  77.83 
 
 
205 aa  317  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  76.85 
 
 
205 aa  314  7e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  60.41 
 
 
198 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.51 
 
 
198 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  60.41 
 
 
199 aa  240  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  63.64 
 
 
197 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  58.97 
 
 
198 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  56.19 
 
 
199 aa  238  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.82 
 
 
202 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  63.1 
 
 
197 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  56.19 
 
 
199 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  60.96 
 
 
201 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.57 
 
 
198 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 
199 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  59.07 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.46 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  57.95 
 
 
201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  58.73 
 
 
201 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  59.89 
 
 
197 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  58.55 
 
 
201 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.55 
 
 
201 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.77 
 
 
200 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.2 
 
 
201 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  56.68 
 
 
202 aa  225  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  56.7 
 
 
200 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.15 
 
 
200 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  56.7 
 
 
200 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  56.7 
 
 
687 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  55.73 
 
 
205 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  57.58 
 
 
202 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.02 
 
 
209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.36 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  58.33 
 
 
200 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  56.77 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.75 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  55.44 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  56.7 
 
 
202 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  54.12 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  54.12 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  55.44 
 
 
200 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.29 
 
 
206 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  58.29 
 
 
206 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.29 
 
 
206 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.67 
 
 
206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  52.36 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  55.73 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  57.53 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.06 
 
 
206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.02 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  55.73 
 
 
218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  58.15 
 
 
203 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  57.29 
 
 
200 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  54.92 
 
 
202 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  57.22 
 
 
205 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  54.17 
 
 
199 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  54.17 
 
 
199 aa  201  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  53.37 
 
 
186 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  54.69 
 
 
190 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  53.65 
 
 
189 aa  197  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.8 
 
 
184 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  49.74 
 
 
197 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  43.3 
 
 
199 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 
208 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.41 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  41.12 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  40 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  39.69 
 
 
199 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  41 
 
 
202 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  41.8 
 
 
200 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  38.86 
 
 
203 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  39.47 
 
 
200 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  40.31 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  37.19 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  36.68 
 
 
203 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
212 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  43.62 
 
 
199 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  36.87 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  38.46 
 
 
200 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  39.47 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  38.95 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  39.47 
 
 
198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  40 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  37 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  37.19 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  37.95 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  37.95 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  37.44 
 
 
200 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  36.82 
 
 
197 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  39.68 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  36 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  40.21 
 
 
200 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  35.57 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>