106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0542 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  56.01 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  54.92 
 
 		 296 aa  301  9e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  33.16 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  32.73 
 
 		 214 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  35.07 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  34.36 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  32.82 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  33.91 
 
 		 261 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  34.15 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  32.51 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  31.56 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  33.16 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  30.85 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  30.93 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  30.35 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  30.73 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  30.73 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  27.6 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  31.43 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  31.71 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  30.35 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  30.73 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  29.85 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  34.13 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  33 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  31.15 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  32.02 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  33.9 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  33.91 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  26.22 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  30.36 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  28.34 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  30.36 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  30.36 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  28.19 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  33.65 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  33.9 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  28.7 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  31.31 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  30.36 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  33.17 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  25.97 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  32.66 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  25.79 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  25.58 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  28.29 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  32.2 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  30.85 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  29.5 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  29.48 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  30.88 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  29.15 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  28.77 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  30.88 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  28.44 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  29.72 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  27.52 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  32.16 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  36.04 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  25.19 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  28.16 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  28.78 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  28.16 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  29.05 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  25.45 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  27.42 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  27.42 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  27.96 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  27.57 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  26.88 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  26.88 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  27.57 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  26.88 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  27.27 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  28.34 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  26.34 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  25.87 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  24.24 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  27.72 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  28.07 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  25.95 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>