More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0461 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 559 aa  1141    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  48.95 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0525  YjeF-like protein  47.59 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.069696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.46 
 
 		 498 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.08 
 
 		 494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 		 520 aa  217  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.24 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.38 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  34.64 
 
 		 496 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.57 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.09 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 		 490 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  34.24 
 
 		 502 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.67 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 		 499 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.52 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 502 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.18 
 
 		 496 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.52 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  32.85 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.13 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  32.81 
 
 		 524 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  34.99 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  32.39 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  32.48 
 
 		 493 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  32.48 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.87 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.88 
 
 		 514 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  32.68 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  34.94 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  33.46 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.24 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.7 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  34 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  33.2 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  29.57 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.84 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  35.28 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.84 
 
 		 504 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.84 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  32.25 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 		 510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.3 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.72 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.44 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  30.52 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  30.21 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.04 
 
 		 513 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.39 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.01 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.9 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.87 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.9 
 
 		 510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.71 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.8 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.11 
 
 		 524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.83 
 
 		 515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.02 
 
 		 529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.75 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.64 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  30.28 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.44 
 
 		 515 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.44 
 
 		 515 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 		 530 aa  163  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 		 492 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.59 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.52 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  29.39 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.44 
 
 		 516 aa  160  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  32.06 
 
 		 487 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 		 506 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  33.03 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  28.54 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.31 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.5 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.35 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  29.81 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.31 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.44 
 
 		 514 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.66 
 
 		 517 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  31.09 
 
 		 531 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.44 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  29.52 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.74 
 
 		 499 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.44 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.44 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  28.97 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.96 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>