48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0408 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  100 
 
 		 148 aa  303  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  46.58 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  31.65 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  30.94 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03580  cytochrome C  26.88 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0385574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  27.14 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  29.85 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  27.34 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  31.13 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  27.45 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  26.9 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  32.59 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  28.38 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5019  cytochrome c'  26.72 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  32.22 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  26.89 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  34.29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  25.49 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  25.19 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  27.86 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  29.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  26.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  28.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  28.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  28.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  28.19 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4970  cytochrome c', putative  24.62 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  24.83 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  32.76 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  28.08 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  24.32 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  28.12 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  30.39 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  29.75 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  24.84 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  27.18 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  28.37 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  32.79 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  27.87 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  34.55 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  27.87 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  31.67 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  35 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  27.45 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>