More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0387 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  52.78 
 
 
1135 aa  965    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0381  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.35 
 
 
1169 aa  910    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0210109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1157 aa  2366    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128983  unclonable  0.00000000207996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.58 
 
 
905 aa  342  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.15 
 
 
932 aa  337  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.25 
 
 
917 aa  336  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.79 
 
 
906 aa  333  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  29.45 
 
 
932 aa  333  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.89 
 
 
929 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
933 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.75 
 
 
933 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.16 
 
 
933 aa  328  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
932 aa  328  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
933 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.57 
 
 
927 aa  327  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  30.84 
 
 
917 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.04 
 
 
935 aa  325  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.69 
 
 
935 aa  324  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.69 
 
 
935 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.22 
 
 
937 aa  322  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.07 
 
 
935 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.01 
 
 
918 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.19 
 
 
937 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.19 
 
 
933 aa  311  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.06 
 
 
922 aa  310  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.49 
 
 
918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.49 
 
 
918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.49 
 
 
918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.49 
 
 
918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.39 
 
 
918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.77 
 
 
928 aa  308  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.38 
 
 
931 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.28 
 
 
948 aa  302  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.03 
 
 
930 aa  301  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.59 
 
 
929 aa  297  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.39 
 
 
941 aa  296  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.51 
 
 
942 aa  295  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1369 aa  268  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1069 aa  268  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
956 aa  255  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
876 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1284 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 
833 aa  250  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
929 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
1384 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  39.9 
 
 
925 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  39.84 
 
 
925 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
1267 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
919 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
917 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1305 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.3 
 
 
1053 aa  241  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.49 
 
 
1331 aa  241  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.78 
 
 
1765 aa  241  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 
1611 aa  240  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  28.22 
 
 
1574 aa  239  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
818 aa  239  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
917 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
1016 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1245 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.25 
 
 
1763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
917 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.52 
 
 
922 aa  234  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
916 aa  234  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1118 aa  233  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.3 
 
 
926 aa  232  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.33 
 
 
1499 aa  232  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1255 aa  232  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1548 aa  232  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.52 
 
 
921 aa  231  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
916 aa  231  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
899 aa  231  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1266 aa  231  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
1820 aa  230  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.94 
 
 
918 aa  230  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
925 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
950 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
930 aa  229  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  35.07 
 
 
910 aa  229  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.4 
 
 
2213 aa  229  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 
1165 aa  229  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 
1005 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
1310 aa  228  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
918 aa  228  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
1768 aa  228  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
921 aa  227  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.73 
 
 
952 aa  227  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1009 aa  224  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  26.94 
 
 
2035 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1771 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  34.58 
 
 
910 aa  222  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
1258 aa  222  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>