More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0337 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.55 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  66.19 
 
 		 277 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.09 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.27 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.27 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.91 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.27 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.76 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.91 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.26 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.79 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.79 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.53 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.43 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.5 
 
 		 277 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.16 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.38 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  44 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.43 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.1 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.99 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.14 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.37 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.3 
 
 		 275 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  41.4 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.24 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.59 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.01 
 
 		 273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.55 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.24 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.03 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.79 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.76 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.12 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.52 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.64 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.94 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.77 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.16 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.86 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.12 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.16 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.83 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.43 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>