177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0310 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  588  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  71.64 
 
 
272 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  70.91 
 
 
272 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  45.76 
 
 
274 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  44.44 
 
 
266 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  43.33 
 
 
272 aa  225  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  35.84 
 
 
286 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  33.98 
 
 
280 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  32.36 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  32.36 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  32.49 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  32.83 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  30.66 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  28.31 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  29 
 
 
282 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  27.07 
 
 
293 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  25.77 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  28.62 
 
 
387 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  27.51 
 
 
282 aa  92  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  27.51 
 
 
282 aa  92  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  29.21 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.96 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  29.81 
 
 
301 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  25.43 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  24.64 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  24.64 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  24.64 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  24.64 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  24.64 
 
 
281 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  27.07 
 
 
240 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  24.82 
 
 
281 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  29.81 
 
 
300 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  29.32 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  28.36 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  26.04 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  23.91 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  27.24 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  27.94 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  28.79 
 
 
240 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  23.55 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  26.09 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.39 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  26.79 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  23.79 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  27.88 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  30.82 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  25.09 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  33.97 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  26.52 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  35.17 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  30.57 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.27 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  25.58 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  34.84 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  26.79 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  24.75 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.07 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  24.44 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  24.44 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  24.44 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  25.5 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  26.38 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  26.38 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  23.63 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  25.17 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25.48 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  24.71 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.19 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  30.46 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.14 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.53 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  25.68 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  24.44 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  24.25 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  28.4 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  27.55 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  26.19 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  32.53 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  24.91 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  23.37 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  29.02 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  24.9 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  26.88 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25.84 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  23.88 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  24.44 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  24.34 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  27.8 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  26.22 
 
 
248 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  29.51 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  32.69 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  23.03 
 
 
298 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  25.29 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  25.27 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  23.39 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  33.1 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>