More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0307 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  82.38 
 
 
447 aa  738    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  82.38 
 
 
447 aa  738    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  100 
 
 
445 aa  886    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  48.73 
 
 
434 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  46.58 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  47.26 
 
 
435 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  46.58 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  46.8 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  47.95 
 
 
435 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  46.58 
 
 
432 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  46.58 
 
 
432 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  46.35 
 
 
432 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  46.35 
 
 
432 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  46.35 
 
 
432 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  46.77 
 
 
433 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  45.68 
 
 
434 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  46.36 
 
 
434 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  46.65 
 
 
434 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  46.42 
 
 
434 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  46.42 
 
 
434 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  45.08 
 
 
432 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  46.19 
 
 
434 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  46.42 
 
 
434 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  46.35 
 
 
434 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  43.18 
 
 
436 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  44.04 
 
 
444 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  47.37 
 
 
441 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  45.77 
 
 
432 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  44.34 
 
 
434 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  46.53 
 
 
436 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  46.3 
 
 
436 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  46.3 
 
 
436 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  42.86 
 
 
435 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  44.06 
 
 
434 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  44.83 
 
 
434 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  45.6 
 
 
436 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  44.7 
 
 
434 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  44.7 
 
 
434 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  45.75 
 
 
434 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  44.7 
 
 
434 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  45.23 
 
 
434 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  45.03 
 
 
434 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  44.75 
 
 
437 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  45.37 
 
 
436 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  43.32 
 
 
435 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  44.91 
 
 
436 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  43.96 
 
 
436 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  45.43 
 
 
434 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  44.57 
 
 
434 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  43.55 
 
 
435 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  44.34 
 
 
443 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  44.44 
 
 
437 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  44.58 
 
 
432 aa  358  9e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  44.21 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  42.36 
 
 
436 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  40.64 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  39.22 
 
 
437 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  40.7 
 
 
448 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  39.82 
 
 
436 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  39.82 
 
 
436 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  38.64 
 
 
436 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  38.99 
 
 
437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  39.09 
 
 
436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  39.46 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  37.3 
 
 
436 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  37.59 
 
 
437 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  37.78 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  36.67 
 
 
443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  38.67 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  37.81 
 
 
448 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  36.67 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  37.9 
 
 
448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  37.59 
 
 
448 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  38.13 
 
 
448 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  37.95 
 
 
448 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  37.73 
 
 
449 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  37.95 
 
 
448 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  37.13 
 
 
448 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  37.13 
 
 
448 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  37.13 
 
 
448 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  37.13 
 
 
448 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  36.59 
 
 
436 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  37.87 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0308812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>