More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0294 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  74.71 
 
 
609 aa  946    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
609 aa  1248    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  75.7 
 
 
609 aa  957    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
586 aa  658    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
589 aa  628  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
589 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
588 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
586 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
592 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
587 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
584 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
611 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
587 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
579 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
579 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
587 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
585 aa  542  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
559 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
554 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
554 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
554 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
556 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
570 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
561 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
561 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
559 aa  452  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
551 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
551 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
551 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
557 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
563 aa  439  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
556 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
556 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
561 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
562 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
563 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
556 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
556 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
556 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
561 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 
551 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
550 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
556 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
568 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
562 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
564 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
556 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
564 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
553 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
564 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
551 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
605 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
556 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
546 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
575 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
556 aa  399  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
546 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
597 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
590 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
562 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
598 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
550 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
597 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
598 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
583 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
550 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
581 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
597 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
553 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
583 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
550 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
550 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
597 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>