More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0275 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  100 
 
 		 422 aa  871    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.19 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.58 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.9 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  52.79 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  52.54 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  54.41 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  53.16 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.15 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.16 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  51.78 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  53.16 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  52.41 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.16 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.66 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.91 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  51.14 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.16 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  52.15 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  52.66 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  52.78 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.65 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.66 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.66 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.03 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.15 
 
 		 397 aa  415  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.44 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  52.15 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  52.28 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  52.41 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.67 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.16 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.39 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.42 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  52.42 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.39 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  51.14 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  49.87 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.89 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  51.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  51.39 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  51.65 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.5 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  51.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  51.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.16 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.53 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  50.89 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.38 
 
 		 398 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  48.06 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  48.5 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.4 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.39 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.45 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.87 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.58 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  30.79 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  31.64 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.69 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.42 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.62 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  32.62 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.05 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  30.52 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.41 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.34 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.15 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  31.88 
 
 		 433 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  31.88 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.6 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  31.59 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.11 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  31.06 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  31.88 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  31.88 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.43 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.87 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.49 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.35 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.49 
 
 		 462 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.87 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.25 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.46 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  30.79 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  26.93 
 
 		 440 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.58 
 
 		 456 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6075  nucleotide sugar dehydrogenase  30.28 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.52 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.25 
 
 		 445 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.16 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>