More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0260 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 429 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  70 
 
 		 429 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  86.15 
 
 		 426 aa  783    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 429 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  100 
 
 		 426 aa  885    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  85.45 
 
 		 426 aa  780    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  70.79 
 
 		 428 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  70.23 
 
 		 429 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  70.33 
 
 		 428 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.86 
 
 		 427 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  69.53 
 
 		 429 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  70 
 
 		 429 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  69.3 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  69.91 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  65.81 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  66.28 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  66.28 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  67.92 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  65.12 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  68.63 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  66.43 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  64.19 
 
 		 454 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  63.26 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  66.27 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  63.87 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  62.65 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  62.65 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  62.88 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  63.95 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  63.26 
 
 		 438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  65.03 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  65.63 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  63.03 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  65.54 
 
 		 432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  64.82 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  65.06 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  63.32 
 
 		 431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  64.49 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  62.95 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  62.56 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  62 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  62.95 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  65.06 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  62.68 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  63.17 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  65.5 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  61.86 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  62.68 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  65.03 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  65.97 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  64.17 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  62.95 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  65.31 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  62.85 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  65.36 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  64.49 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  64.49 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  62.62 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  64.58 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  64.82 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  63.03 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  65.31 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  61.86 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  64.25 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  63.21 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  63.12 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  62.56 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  64.1 
 
 		 433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  65.27 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  62.15 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  63.79 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  63.37 
 
 		 433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  63.13 
 
 		 433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  64.57 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  62.09 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>