240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0211 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  100 
 
 
110 aa  230  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  63.21 
 
 
114 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  62.26 
 
 
114 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  44.95 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  47.17 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  45.28 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  45.28 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  43.12 
 
 
101 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  44.04 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  44.34 
 
 
98 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  48.11 
 
 
102 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  42.99 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  42.99 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  42.99 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  43.62 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  44.14 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  40.37 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  41.49 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  39.62 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  39.42 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  42.86 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  40.86 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  43.24 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  39.25 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  42.73 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  41.82 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  42.55 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  38.32 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  42.57 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  39.64 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  41.12 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  38.32 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  39.25 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  38.32 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  47.67 
 
 
91 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  38.1 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  37.96 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  41.96 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  39.8 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  39.78 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  38.68 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  45.36 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  40.45 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  37.61 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  37.04 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  37.96 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  38.68 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  38.68 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  37.14 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  38.46 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  40.43 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  36.84 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  37.96 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  37.89 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  37.89 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  51.79 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  51.79 
 
 
79 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  38.61 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  39.02 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  37.89 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  56 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  44.87 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  41.11 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  37.63 
 
 
93 aa  57.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  44.3 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  44.3 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  48.28 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  48.28 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  37.21 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  37.65 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  50 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  48.28 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  33.64 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  34.57 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  48.28 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  38.82 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  49.09 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  36.96 
 
 
101 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  37.36 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  50 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  34.07 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  38.1 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  43.86 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  43.86 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>