More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0182 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0182  ABC-3 protein  100 
 
 		 264 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0759014  decreased coverage  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  72.03 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  72.03 
 
 		 277 aa  309  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  36.4 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  41.39 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  41.06 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  40.84 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  40.68 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  40.68 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  40.68 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  40.84 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  40.84 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  40.68 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  40.84 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  40.84 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  40.84 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  40.84 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  39.39 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  40.46 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  41.86 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  39.16 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  38.89 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  38.84 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  38.43 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  38.89 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  36.92 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  36.02 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 286 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  40.71 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  39.13 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  38.87 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  40.32 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  41.11 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  41.11 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  41.11 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  40.57 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  36.58 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.8 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  37.24 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  39.83 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  37.04 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.96 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  38.08 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  36 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  36.21 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  34.18 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  37.24 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  36.05 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  34.44 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  34.44 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  37.19 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  36.8 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  39.56 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  34.51 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  34.48 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.8 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  35.93 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  29.15 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.37 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.06 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  31.38 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.53 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  29.52 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  32.75 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.02 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.61 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  28.06 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.72 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.13 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.13 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.84 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.73 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>