More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0170 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  100 
 
 
246 aa  511  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  73.88 
 
 
245 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  74.29 
 
 
245 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  37.93 
 
 
263 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  38.08 
 
 
261 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  40.97 
 
 
262 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
263 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  38.43 
 
 
262 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  38.84 
 
 
262 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  38.43 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  40 
 
 
263 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  37.65 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  36.86 
 
 
259 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  37.25 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  36.84 
 
 
263 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  36.62 
 
 
269 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  38.76 
 
 
268 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  36.23 
 
 
270 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 
263 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  36.02 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  35.29 
 
 
267 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  33.48 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  34.12 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  35.27 
 
 
262 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.41 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  36 
 
 
264 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
280 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  31.86 
 
 
238 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.4 
 
 
264 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  31.42 
 
 
238 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  33.76 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  31.73 
 
 
264 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  33.95 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  38.55 
 
 
237 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  33.78 
 
 
234 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  33.49 
 
 
239 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  31.22 
 
 
242 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  32.9 
 
 
237 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 
246 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 
258 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 
261 aa  121  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  32.38 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  32.42 
 
 
241 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  29.19 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 
237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  28.71 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 
234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 
241 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 
245 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 
262 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
263 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 
241 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  26.19 
 
 
241 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 
267 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
241 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 
265 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
249 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 
264 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
227 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 
227 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 
356 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 
243 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  31.89 
 
 
234 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  27.23 
 
 
296 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  30.73 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  25.94 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.74 
 
 
290 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  30.97 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.51 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 
290 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
278 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 
269 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.9 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  29.31 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  29.31 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.22 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.24 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>