More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0152 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0152  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0070  triosephosphate isomerase  49.63 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626073  normal  0.320035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0065  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.914052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  41.47 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  41.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  40.31 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  40.7 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  41.09 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  38.64 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  40.7 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  39.02 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  40.53 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  37.31 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  38.76 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  38.85 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00709  triosephosphate isomerase  38.67 
 
 		 250 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  36.98 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  39.77 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  36.78 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  38.64 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  37.12 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  39 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  38.17 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  38.61 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2243  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  37.31 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  38.64 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  37.36 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  36.74 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  38.26 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  39.62 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  39.08 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  37.88 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  38.52 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  40.38 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  39 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  42.16 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  39.53 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  39.62 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001760  triosephosphate isomerase  38.65 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  38.93 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0283  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  38.7 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  37.07 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  40.77 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  39.69 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.27 
 
 		 655 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  40.47 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  39.62 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  37.35 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  38.2 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  36.68 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  37.98 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  39.18 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  41.51 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  39.69 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  37.79 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  38.52 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  39.15 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  38.67 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  38.76 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  35.42 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.31 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 248 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  36.8 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>