274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0140 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  100 
 
 		 97 aa  203  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  63.54 
 
 		 86 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  60.87 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  51.81 
 
 		 82 aa  90.5  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  50 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  48.78 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  47.56 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  44.32 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  47.67 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  46.43 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  45.12 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  49.37 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  49.37 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  49.37 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  44.44 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  50.75 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  41.38 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  48.1 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  46.34 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  47.5 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  46.51 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  43.9 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  42.35 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  43.9 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  56.9 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  56.9 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  56.9 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  42.17 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  41.46 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  42.68 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  41.46 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  43.68 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  46.88 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  40.24 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  41.46 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  40.51 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  39.24 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  40 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  38.27 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  38.81 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  29.76 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  34.92 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  41.27 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  34.38 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  37.93 
 
 		 76 aa  57  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  36.07 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  36.07 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  35 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  29.03 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  31.4 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  29.41 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  36.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  31.25 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  32.86 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  36.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  39.66 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  34.18 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  30 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  30.77 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  35.94 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  30.16 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  34.43 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.67 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  33.33 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  29.03 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  38.6 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.38 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  36.51 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  31.67 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  39.68 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>