283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0127 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  72.5 
 
 
763 aa  1096  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
760 aa  1545  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  73.12 
 
 
764 aa  1100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  44.35 
 
 
622 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  45.72 
 
 
611 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  45.72 
 
 
611 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  43.87 
 
 
599 aa  516  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 
602 aa  518  1e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  44.28 
 
 
597 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  47.11 
 
 
617 aa  508  1e-142  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  47.17 
 
 
616 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  44.73 
 
 
670 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  43.73 
 
 
598 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.73 
 
 
669 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  45.7 
 
 
601 aa  495  1e-138  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  43.43 
 
 
637 aa  495  1e-138  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  44.09 
 
 
625 aa  494  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.30765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  45.14 
 
 
616 aa  493  1e-138  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12153e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  44.56 
 
 
673 aa  494  1e-138  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 
611 aa  495  1e-138  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  43.31 
 
 
660 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 
601 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 
660 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.62767e-05  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  44.14 
 
 
670 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  46.73 
 
 
608 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  44.91 
 
 
660 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.55921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  43.91 
 
 
660 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  45.36 
 
 
601 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  44.17 
 
 
599 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  42.25 
 
 
651 aa  479  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  44.13 
 
 
719 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.98 
 
 
666 aa  469  1e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  42.6 
 
 
643 aa  472  1e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  43.37 
 
 
619 aa  471  1e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  44.38 
 
 
569 aa  466  1e-130  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  41.05 
 
 
607 aa  459  1e-128  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  43.11 
 
 
702 aa  460  1e-128  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  40.31 
 
 
602 aa  422  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  38.7 
 
 
625 aa  358  1e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  39.5 
 
 
852 aa  358  3e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 
604 aa  341  3e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.67 
 
 
640 aa  319  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  31.83 
 
 
596 aa  296  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.69 
 
 
596 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.83 
 
 
596 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 
596 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.74 
 
 
596 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.74 
 
 
596 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.21 
 
 
606 aa  293  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.74 
 
 
596 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 
623 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  35.11 
 
 
584 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
640 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 
629 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
660 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 
637 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 
610 aa  238  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 
641 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 
741 aa  235  2e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
628 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
639 aa  234  4e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 
652 aa  234  4e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 
652 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.78 
 
 
595 aa  231  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.3 
 
 
612 aa  230  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 
607 aa  228  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 
609 aa  222  2e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 
617 aa  201  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 
620 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  37.41 
 
 
593 aa  193  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  37.2 
 
 
407 aa  185  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 
617 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 
630 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
626 aa  162  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 
628 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.17 
 
 
399 aa  149  1e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 
401 aa  143  1e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.5 
 
 
401 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  30.72 
 
 
421 aa  135  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 
399 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 
414 aa  127  8e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 
414 aa  127  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 
414 aa  122  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 
402 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.79 
 
 
597 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.9 
 
 
421 aa  113  1e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  28.41 
 
 
626 aa  110  8e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.35 
 
 
581 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 
487 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.6 
 
 
580 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.65 
 
 
596 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.34 
 
 
597 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 
478 aa  100  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  29.2 
 
 
499 aa  99.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.16 
 
 
581 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  28.1 
 
 
577 aa  97.8  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.97 
 
 
486 aa  97.8  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 
577 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 
577 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 
577 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>