40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0118 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  736    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  47.32 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  47.32 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  35.71 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  37.71 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  35.34 
 
 		 364 aa  199  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  34.86 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  36.57 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  35.26 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  30.11 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  27.49 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  26.3 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  26.95 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  36 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  25.98 
 
 		 650 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  26.92 
 
 		 632 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  33.59 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  25.93 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  31.25 
 
 		 534 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.9 
 
 		 699 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  29.01 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  31.78 
 
 		 631 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  27.14 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.25 
 
 		 706 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.47 
 
 		 706 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.47 
 
 		 706 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  22.37 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  25.97 
 
 		 700 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.95 
 
 		 691 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  31.85 
 
 		 450 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  27.91 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  34.41 
 
 		 638 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  24.67 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  34.48 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  34.48 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.39 
 
 		 746 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  30.32 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 688 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.98 
 
 		 696 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>