More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0093 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.81 
 
 		 274 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.58 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.27 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.11 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.08 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.38 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  34.96 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.57 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  35.78 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  35.78 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.6 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.6 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0982  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1052  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  27.78 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  27.44 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  34.24 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.33 
 
 		 301 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.61 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.94 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.76 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 665 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.64 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 671 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.89 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>