174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0090 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  841    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  63.64 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  60.93 
 
 
436 aa  511  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
439 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
413 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  31.58 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
398 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  32.06 
 
 
406 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  31.28 
 
 
416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  31.99 
 
 
426 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  33.6 
 
 
402 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  31.41 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  30.33 
 
 
411 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  31.38 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  31.51 
 
 
393 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  31.51 
 
 
393 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  31.51 
 
 
393 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  31.51 
 
 
393 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  31.51 
 
 
393 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  31.51 
 
 
393 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  31.7 
 
 
426 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  31.12 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.7 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
361 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  31.25 
 
 
393 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  31.61 
 
 
409 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  31.25 
 
 
393 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  30.38 
 
 
414 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  32.29 
 
 
394 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  32.29 
 
 
394 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  32.29 
 
 
394 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  27.23 
 
 
434 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  32.29 
 
 
394 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  32.03 
 
 
394 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
396 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  30.05 
 
 
434 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
399 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  31.7 
 
 
424 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  26.8 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  30.18 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  29.43 
 
 
395 aa  146  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  28.14 
 
 
409 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
403 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.27 
 
 
368 aa  144  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
435 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
397 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
401 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  31.41 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  27.16 
 
 
404 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  29.78 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
397 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  34.09 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  30.27 
 
 
403 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
404 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
404 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.47 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  29.27 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  27.69 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  29.02 
 
 
403 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  29.02 
 
 
403 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  29.21 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  26.44 
 
 
426 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  29.87 
 
 
451 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  28.29 
 
 
455 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
496 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  28.49 
 
 
432 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  29.09 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  29.35 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  29.1 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  28.94 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  28.65 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  28.83 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  29.89 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  28.39 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  27.09 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
430 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  28.93 
 
 
405 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  26.86 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  29.23 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  26.74 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  27.53 
 
 
466 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  26.2 
 
 
404 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
430 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  24.04 
 
 
396 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.65 
 
 
398 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  27.55 
 
 
459 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  25.18 
 
 
390 aa  106  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>