More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0089 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  71.66 
 
 
443 aa  674    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  72.02 
 
 
444 aa  677    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0089  valine--pyruvate transaminase  100 
 
 
434 aa  896    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3725  valine--pyruvate transaminase  49.42 
 
 
417 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00447  valine--pyruvate transaminase  48.03 
 
 
417 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0943  valine--pyruvate transaminase  45.54 
 
 
425 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.784655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002002  valine--pyruvate aminotransferase  47.56 
 
 
417 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2963  valine--pyruvate transaminase  46.76 
 
 
415 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1586  valine--pyruvate transaminase  45.71 
 
 
419 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  45.94 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2635  valine--pyruvate transaminase  45.71 
 
 
416 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1771  valine--pyruvate transaminase  45.39 
 
 
424 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  44.03 
 
 
418 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3063  valine--pyruvate transaminase  45.62 
 
 
420 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  44.73 
 
 
416 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0050  valine--pyruvate transaminase  43.85 
 
 
417 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  45.09 
 
 
417 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0014  valine--pyruvate transaminase  44.37 
 
 
456 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4140  valine--pyruvate transaminase  44.14 
 
 
421 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0149  valine--pyruvate transaminase  44.26 
 
 
416 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03424  valine-pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0138  aminotransferase class I and II  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3950  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0142  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4069  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03375  hypothetical protein  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4948  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.458288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3775  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3895  valine--pyruvate transaminase  44.21 
 
 
417 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0053  valine--pyruvate transaminase  44.39 
 
 
440 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.100706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3863  valine--pyruvate transaminase  43.85 
 
 
416 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3988  valine--pyruvate transaminase  43.85 
 
 
416 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3943  valine--pyruvate transaminase  43.85 
 
 
416 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.796758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4049  valine--pyruvate transaminase  43.98 
 
 
416 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.714309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3879  valine--pyruvate transaminase  43.75 
 
 
416 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3792  valine--pyruvate transaminase  43.99 
 
 
402 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1487  valine--pyruvate transaminase  42.24 
 
 
424 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.41369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1678  aminotransferase class I and II  42.19 
 
 
426 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0903  valine--pyruvate transaminase  41.07 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.176446  decreased coverage  0.0000000925124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1090  valine--pyruvate transaminase  36.64 
 
 
427 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4228  valine--pyruvate transaminase  37.53 
 
 
419 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2258  valine--pyruvate transaminase  34.48 
 
 
427 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.782201  normal  0.105483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0165  class I/II aminotransferase  34.33 
 
 
427 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0914098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3688  valine--pyruvate transaminase  33.64 
 
 
421 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 
413 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  23.71 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  25.61 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  24.33 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  24.2 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  23.72 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  23.72 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  23.08 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  23.99 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.63 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  25.24 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  25.36 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  24.94 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  23.94 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  25.36 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  25 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  24.73 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  24.32 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  25.64 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  23.26 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  23.71 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  27.94 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  24.05 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  28.21 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  23.27 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  21.66 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  23.26 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  22.8 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  25.4 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.1 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  22.61 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  21.63 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  23.34 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  30.9 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  22.27 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.33 
 
 
468 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.75 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>