49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0085 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  100 
 
 		 345 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  61.18 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  60.49 
 
 		 327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  42.2 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  42.86 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  42.72 
 
 		 316 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  42.55 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  41.05 
 
 		 319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  41.05 
 
 		 319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  40.74 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  42.73 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  39.88 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  39.69 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  38.94 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  31.95 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  31.95 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  31.07 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  29.35 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  28.91 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  28.1 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  27.57 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  27.84 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  28.27 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  26.9 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  27.12 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  25.81 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  25.16 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  25 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  25.16 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  26.55 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  25 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  28.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  24.64 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  24.83 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  26.95 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  24.61 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  23.26 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  23.64 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  23.64 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  23.64 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  23.64 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  24.48 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  27.54 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  37.31 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  36.67 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  28.31 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  26.99 
 
 		 269 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  29.3 
 
 		 292 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>