147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0080 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  100 
 
 
412 aa  853    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  68.21 
 
 
427 aa  595  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  69.05 
 
 
419 aa  593  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  52.8 
 
 
394 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  52.8 
 
 
394 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  52.8 
 
 
394 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  49.39 
 
 
384 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  49.02 
 
 
385 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  44.1 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  43.54 
 
 
401 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  42.58 
 
 
389 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  40.1 
 
 
370 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  34.25 
 
 
432 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  36.82 
 
 
418 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  36.59 
 
 
404 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  42.08 
 
 
225 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  31.58 
 
 
401 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  41.23 
 
 
226 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  40.85 
 
 
233 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  38.99 
 
 
244 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  41.23 
 
 
245 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  36.81 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  26.63 
 
 
402 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  26.63 
 
 
401 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  34.42 
 
 
191 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  34.46 
 
 
233 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  31.94 
 
 
191 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  31.94 
 
 
191 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  26.01 
 
 
401 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  32.8 
 
 
191 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  32.95 
 
 
449 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  36.42 
 
 
192 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  33.53 
 
 
479 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  30.46 
 
 
191 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  33.33 
 
 
191 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  33.33 
 
 
192 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  34.64 
 
 
191 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  27.94 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  30.77 
 
 
560 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  31.13 
 
 
191 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  32.89 
 
 
191 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  32.89 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  37.06 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  31.13 
 
 
191 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  32.07 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  30.07 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  30.07 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  30.07 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  30.11 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  25.44 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  30.86 
 
 
722 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  30.26 
 
 
192 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  30.32 
 
 
192 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  29.8 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  31.58 
 
 
192 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  29.8 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  30.46 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  29.68 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  31.17 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  27.57 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  27.92 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  33.92 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  30.92 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  30.32 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  30.13 
 
 
192 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  30.26 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  27.75 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  27.75 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  27.75 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  27.74 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  29.22 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  27.12 
 
 
528 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  27.1 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  27.08 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
196 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  27.1 
 
 
196 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  28.39 
 
 
191 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  26.62 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  27.1 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.32 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  26.45 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3023  stress protein  29.94 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102186  hitchhiker  0.000574983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  29.33 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  28.39 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  26.45 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  27.1 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  25.65 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  31.51 
 
 
675 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  30.06 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  29.87 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  26.45 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  27.92 
 
 
191 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  33.54 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  28.39 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  29.61 
 
 
190 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  28.19 
 
 
192 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>