193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0077 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  85.34 
 
 
191 aa  345  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  85.34 
 
 
191 aa  345  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  69.84 
 
 
192 aa  285  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  69.84 
 
 
192 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  69.84 
 
 
192 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  69.84 
 
 
191 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  67.72 
 
 
192 aa  279  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  67.54 
 
 
191 aa  275  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  66.14 
 
 
192 aa  274  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  67.02 
 
 
191 aa  274  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  66.49 
 
 
192 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  66.67 
 
 
191 aa  270  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  65.08 
 
 
191 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  65.97 
 
 
191 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  65.45 
 
 
191 aa  262  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  61.78 
 
 
192 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  63.87 
 
 
191 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  65.08 
 
 
191 aa  258  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  63.87 
 
 
191 aa  258  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  63.87 
 
 
191 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  63.35 
 
 
191 aa  257  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  62.83 
 
 
191 aa  257  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  62.3 
 
 
192 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  62.83 
 
 
192 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  62.3 
 
 
192 aa  250  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  60.73 
 
 
191 aa  249  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  62.3 
 
 
191 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  61.26 
 
 
191 aa  248  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  63.87 
 
 
222 aa  248  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  62.83 
 
 
191 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  63.35 
 
 
191 aa  247  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  61.26 
 
 
192 aa  247  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  58.12 
 
 
192 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  60.73 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  60.21 
 
 
191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  61.78 
 
 
191 aa  242  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  62.11 
 
 
192 aa  242  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  58.12 
 
 
192 aa  241  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  58.64 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  59.16 
 
 
248 aa  237  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  58.64 
 
 
192 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  59.47 
 
 
192 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  59.47 
 
 
192 aa  234  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  59.47 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  58.95 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  58.42 
 
 
192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  57.59 
 
 
191 aa  227  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  56.08 
 
 
191 aa  224  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  57.45 
 
 
192 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  54.97 
 
 
194 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  54.26 
 
 
192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  54.74 
 
 
190 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  54.45 
 
 
191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  53.4 
 
 
194 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  52.88 
 
 
196 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  52.88 
 
 
196 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  52.88 
 
 
196 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  52.88 
 
 
194 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  52.88 
 
 
194 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  52.88 
 
 
194 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  52.36 
 
 
194 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  52.36 
 
 
194 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  51.83 
 
 
194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  53.44 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  56.25 
 
 
194 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  56.25 
 
 
194 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  55.79 
 
 
193 aa  208  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  56.32 
 
 
205 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  55.61 
 
 
194 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  51.06 
 
 
191 aa  204  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  54.08 
 
 
194 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  47.87 
 
 
189 aa  201  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  52.36 
 
 
186 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  49.47 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  50.53 
 
 
192 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  50.53 
 
 
192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  46.32 
 
 
192 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  46.32 
 
 
192 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  50 
 
 
184 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  46.6 
 
 
218 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  43.94 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  41.87 
 
 
200 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  46.56 
 
 
184 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5504  stress protein  42.4 
 
 
218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390386  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  41.94 
 
 
199 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  41.4 
 
 
199 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1164  stress protein  41.27 
 
 
191 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  41.8 
 
 
418 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0761  tellurium resitance protein TerZ  44.44 
 
 
202 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228615  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0767  stress protein  44.44 
 
 
202 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1008  stress protein  43.92 
 
 
195 aa  148  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1165  stress protein  44.66 
 
 
222 aa  148  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  40 
 
 
198 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0079  stress protein  41.71 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.244583  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  40 
 
 
198 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0635  stress response protein  43.09 
 
 
193 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>