103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0069 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  100 
 
 		 534 aa  1115    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  48.7 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  44.77 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  41.4 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  39.85 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  39.34 
 
 		 543 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  34.21 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  33.46 
 
 		 541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  34.41 
 
 		 538 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  31.78 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  31.33 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  30.56 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  31.07 
 
 		 513 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  34.74 
 
 		 543 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  27.21 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.72 
 
 		 556 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.58 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.52 
 
 		 1150 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 547 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.69 
 
 		 572 aa  93.6  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  22.64 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  24.44 
 
 		 653 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  24.44 
 
 		 632 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  24.44 
 
 		 632 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  24.73 
 
 		 552 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  24.44 
 
 		 632 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  24.56 
 
 		 632 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  24.44 
 
 		 632 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 623 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.4 
 
 		 1152 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.03 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.72 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.51 
 
 		 583 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1152 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1150 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 889 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  22.94 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.44 
 
 		 1132 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.44 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.45 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.84 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 578 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 563 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.95 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.92 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  25.76 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  22.54 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 581 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  25.53 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  38.46 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.37 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3158  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 567 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.92 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 		 546 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 577 aa  50.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.99 
 
 		 570 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.92 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  25.23 
 
 		 622 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4030  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.37 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.99 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.78 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1428  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.93 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.98 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2161  choline dehydrogenase  27.87 
 
 		 588 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 577 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.64 
 
 		 535 aa  47.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.29 
 
 		 532 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  31.15 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07267  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.534506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.618837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.29 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.31 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  25.16 
 
 		 546 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.39 
 
 		 529 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.25 
 
 		 565 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.84 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.77 
 
 		 546 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.16 
 
 		 536 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  23.81 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.34 
 
 		 562 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1388  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.48 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 510 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  24.67 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.43 
 
 		 501 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.51 
 
 		 518 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>