More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0068 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.72 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  36.23 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.96 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.32 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.89 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.09 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  27.99 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.99 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.55 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.15 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.62 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 		 279 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.15 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.46 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  28.62 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.55 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.72 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  27.72 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>