132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0037 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  764    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  55.05 
 
 
361 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  55.05 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  34.81 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
285 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  32.22 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.44 
 
 
237 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.52 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  32.75 
 
 
244 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  33.14 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.35 
 
 
239 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.93 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.1 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.1 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.1 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.98 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  30.18 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.41 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.41 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.41 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.41 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.41 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.71 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.28 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.59 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.59 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  32.2 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.83 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.93 
 
 
245 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.85 
 
 
245 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.69 
 
 
236 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.34 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.88 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.85 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.7 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.38 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.38 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  38.64 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  38.64 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.64 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.63 
 
 
260 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  31.77 
 
 
238 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.42 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.6 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  38.17 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.17 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.17 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.17 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.17 
 
 
236 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.9 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.91 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.18 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.63 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.81 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  28.28 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.91 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.68 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  32.45 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.09 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  31.79 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.41 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.69 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.79 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.79 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.79 
 
 
241 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  35.16 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.83 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.08 
 
 
241 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
251 aa  67  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  31.15 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.39 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  32.12 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  25.7 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.72 
 
 
262 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.78 
 
 
255 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.94 
 
 
240 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  30.08 
 
 
187 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  29.27 
 
 
179 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.37 
 
 
210 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.6 
 
 
251 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  31.63 
 
 
178 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  38.32 
 
 
235 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.32 
 
 
250 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  31.73 
 
 
281 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  35.24 
 
 
248 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  35.24 
 
 
248 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  27.69 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  24.61 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  30.16 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.23 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  29.91 
 
 
249 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.26 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  29.91 
 
 
252 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  31.19 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  34.26 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  33.33 
 
 
236 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  35.51 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  31.78 
 
 
233 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  26.98 
 
 
242 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>