237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0035 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  78.06 
 
 
198 aa  324  4e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  77.16 
 
 
198 aa  320  1e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  50.26 
 
 
206 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  50.76 
 
 
201 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  49.48 
 
 
198 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  48.48 
 
 
201 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  42.7 
 
 
209 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  41.86 
 
 
219 aa  161  5e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  40.86 
 
 
204 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  44.86 
 
 
194 aa  155  5e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  44.32 
 
 
194 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  43.62 
 
 
204 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.02 
 
 
194 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.22 
 
 
203 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.22 
 
 
203 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.22 
 
 
203 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.64 
 
 
204 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.84 
 
 
213 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  43.09 
 
 
195 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  43.35 
 
 
239 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  45.45 
 
 
245 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  42.77 
 
 
205 aa  147  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  43.93 
 
 
195 aa  147  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  44.63 
 
 
196 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  44.63 
 
 
196 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  44.63 
 
 
303 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  40.76 
 
 
290 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  44.63 
 
 
303 aa  145  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  44.63 
 
 
303 aa  145  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  42.02 
 
 
195 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  42.7 
 
 
195 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  43.1 
 
 
195 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  44.77 
 
 
303 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  41.67 
 
 
200 aa  140  1e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  37.93 
 
 
207 aa  139  2e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  42.37 
 
 
195 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  42.37 
 
 
195 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  42.37 
 
 
195 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  37.77 
 
 
203 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  41.15 
 
 
197 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  41.33 
 
 
222 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  37.63 
 
 
203 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  41.49 
 
 
206 aa  133  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  38.83 
 
 
203 aa  133  2e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  40.64 
 
 
204 aa  133  2e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.23 
 
 
207 aa  132  4e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  41.38 
 
 
197 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.87 
 
 
207 aa  131  7e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  131  7e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  39.38 
 
 
212 aa  130  1e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.32 
 
 
211 aa  130  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  41.14 
 
 
207 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  38.8 
 
 
204 aa  129  4e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  127  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  127  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  127  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  39.27 
 
 
218 aa  127  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  37.06 
 
 
210 aa  126  2e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  42.16 
 
 
196 aa  126  2e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  127  2e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  127  2e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  38.5 
 
 
204 aa  125  4e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  38.5 
 
 
204 aa  125  4e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  38.5 
 
 
204 aa  125  4e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.08 
 
 
212 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  32.62 
 
 
198 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  39.2 
 
 
232 aa  123  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  33.85 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.98 
 
 
204 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.22 
 
 
225 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  35.43 
 
 
206 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  37.63 
 
 
199 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  37.43 
 
 
204 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  41.15 
 
 
197 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  35.8 
 
 
209 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  39.01 
 
 
209 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  39.56 
 
 
195 aa  121  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  34.24 
 
 
212 aa  120  1e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.86 
 
 
208 aa  120  1e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  35.11 
 
 
203 aa  119  2e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  120  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  35.39 
 
 
211 aa  119  4e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  33.87 
 
 
205 aa  119  4e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  33.88 
 
 
204 aa  119  4e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  37.65 
 
 
203 aa  119  4e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  33.7 
 
 
186 aa  118  5e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  44 
 
 
195 aa  117  8e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  33.71 
 
 
204 aa  117  1e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  34.87 
 
 
204 aa  117  1e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  35.12 
 
 
191 aa  116  2e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  37.97 
 
 
219 aa  116  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  33.91 
 
 
204 aa  116  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>