226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0009 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  100 
 
 		 315 aa  607  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  35.81 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  38.54 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  40.26 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  33.64 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  32.27 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  32.08 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.42 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.67 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.06 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.32 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.33 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.5 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.5 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.67 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.16 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  23.84 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.85 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  29.82 
 
 		 347 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  25.16 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.85 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.41 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  22.85 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  29.44 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.36 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.34 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.89 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  30.2 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  24.53 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.73 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.61 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.46 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.24 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  24.69 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.2 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.37 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.33 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>