More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5283 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  917    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  72.83 
 
 		 460 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  72.47 
 
 		 461 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 		 459 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  41.97 
 
 		 471 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 467 aa  316  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  38.75 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  38.29 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  38.22 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  38.57 
 
 		 468 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  38.51 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 466 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.15 
 
 		 455 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  34.43 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.11 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.56 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.84 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.85 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.42 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.21 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.39 
 
 		 464 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.62 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  32.11 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.15 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 479 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 479 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 423 aa  158  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.02 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.63 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.41 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 399 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  31.97 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>