221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5281 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  100 
 
 		 413 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  55.85 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  54.59 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  57.14 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  55.85 
 
 		 418 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  54.18 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  54.18 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  52.72 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  55.1 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  54.27 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  54.27 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  51.9 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  51.17 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  52.58 
 
 		 418 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  54.16 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  55.04 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  54.95 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  52.9 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  51.72 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  54.09 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  49.76 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  52.15 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  50.36 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  51.69 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  52.05 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  51.14 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  50.74 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  51.4 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  45.72 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  45.85 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  45.12 
 
 		 417 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  42.51 
 
 		 420 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  46.4 
 
 		 417 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  46.32 
 
 		 417 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  45.2 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  45.09 
 
 		 427 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  44.28 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  43.55 
 
 		 416 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  39.51 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  40.75 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  39.27 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  39.27 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  39.95 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  39.71 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  39.47 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  39.67 
 
 		 416 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  43.04 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  40.15 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  40.4 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  40.15 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  40 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  40.4 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  40.25 
 
 		 431 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.53 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  39.03 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  39.03 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  37.83 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  38.52 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  38.15 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  39.51 
 
 		 430 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.11 
 
 		 410 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  37.91 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  39.16 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.91 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  38.62 
 
 		 418 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  38.74 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  37.72 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  38.56 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  35.73 
 
 		 428 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  38.73 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  37.53 
 
 		 416 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  38.14 
 
 		 433 aa  269  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  36.87 
 
 		 433 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.63 
 
 		 429 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  36.8 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  36.89 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  38.3 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  38.21 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  36.38 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  36.9 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  38.67 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  35.43 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.71 
 
 		 424 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  37.41 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  37.72 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  38.42 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.63 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  38.29 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.07 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  37.53 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  35.6 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  34.75 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  36.04 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  36.34 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  34.52 
 
 		 420 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  34.34 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  33.8 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  36.07 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  36.11 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>