182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4907 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  100 
 
 		 557 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1000  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 549 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  63.42 
 
 		 552 aa  712    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  73.84 
 
 		 601 aa  870    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  66.36 
 
 		 552 aa  749    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  79.3 
 
 		 564 aa  895    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0932  urocanate hydratase  77.44 
 
 		 557 aa  886    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  77.39 
 
 		 556 aa  853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  90 
 
 		 607 aa  1038    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  66.36 
 
 		 552 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  66.36 
 
 		 552 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  66.54 
 
 		 552 aa  752    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  824    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  71.27 
 
 		 554 aa  821    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  71.09 
 
 		 554 aa  821    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  88.63 
 
 		 565 aa  1041    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  90.81 
 
 		 557 aa  1063    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  75.64 
 
 		 566 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  90.45 
 
 		 559 aa  1060    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  72.61 
 
 		 562 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  73.16 
 
 		 562 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  91.95 
 
 		 560 aa  1071    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  72.81 
 
 		 908 aa  832    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  72.61 
 
 		 562 aa  826    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  87.75 
 
 		 568 aa  1025    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  66.36 
 
 		 552 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1304  urocanate hydratase  79.38 
 
 		 556 aa  875    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.235615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  74.08 
 
 		 562 aa  835    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  63.72 
 
 		 546 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  77.13 
 
 		 579 aa  885    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  74.73 
 
 		 572 aa  867    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2945  urocanate hydratase  72.06 
 
 		 562 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  75.5 
 
 		 564 aa  844    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  75.14 
 
 		 572 aa  860    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  75.82 
 
 		 568 aa  879    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  90.45 
 
 		 559 aa  1052    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  62.25 
 
 		 557 aa  709    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  63.85 
 
 		 565 aa  710    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3007  urocanate hydratase  74.32 
 
 		 562 aa  843    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1691  urocanate hydratase  78.12 
 
 		 553 aa  878    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  72.61 
 
 		 562 aa  826    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  61.08 
 
 		 554 aa  676    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  75.87 
 
 		 566 aa  867    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  76.36 
 
 		 577 aa  874    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  99.64 
 
 		 557 aa  1150    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2983  urocanate hydratase  75.76 
 
 		 562 aa  870    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.41142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0099  urocanate hydratase  77.39 
 
 		 556 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0094  urocanate hydratase  77.21 
 
 		 556 aa  853    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  76.65 
 
 		 556 aa  852    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  77.66 
 
 		 555 aa  867    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  91.73 
 
 		 559 aa  1077    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0374  urocanate hydratase  62.18 
 
 		 564 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  72.61 
 
 		 562 aa  826    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 570 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0100  urocanate hydratase  77.02 
 
 		 556 aa  851    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0715  urocanate hydratase  77.03 
 
 		 554 aa  876    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  60.99 
 
 		 555 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  77.76 
 
 		 562 aa  872    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1030  urocanate hydratase  74.77 
 
 		 559 aa  853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.235061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2964  urocanate hydratase  74.73 
 
 		 574 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0164648  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  824    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3646  urocanate hydratase  71.89 
 
 		 573 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.455234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2921  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  824    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1580  urocanate hydratase  72.99 
 
 		 560 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21091  normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  77.53 
 
 		 555 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2665  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  824    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  77.53 
 
 		 555 aa  864    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  73.16 
 
 		 562 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1679  urocanate hydratase  72.98 
 
 		 562 aa  824    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3757  urocanate hydratase  77.57 
 
 		 556 aa  866    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  65.62 
 
 		 552 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  60.96 
 
 		 549 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  86.36 
 
 		 561 aa  1003    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  77.35 
 
 		 555 aa  860    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  93.83 
 
 		 553 aa  1078    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1295  urocanate hydratase  78.49 
 
 		 554 aa  881    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0784383  normal  0.0497778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0823  urocanate hydratase  78.17 
 
 		 565 aa  874    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000435883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1749  urocanate hydratase  77.11 
 
 		 556 aa  862    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6450  urocanate hydratase  74.14 
 
 		 556 aa  851    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  61.65 
 
 		 553 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0874  urocanate hydratase  77.8 
 
 		 557 aa  890    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  78.39 
 
 		 555 aa  895    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  100 
 
 		 557 aa  1154    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  73.52 
 
 		 573 aa  857    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  61.76 
 
 		 550 aa  728    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  76.7 
 
 		 559 aa  892    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  61.65 
 
 		 553 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  87.73 
 
 		 563 aa  1027    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  92.28 
 
 		 559 aa  1073    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  62.98 
 
 		 554 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  77.53 
 
 		 555 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1433  urocanate hydratase  78.52 
 
 		 557 aa  895    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  65.99 
 
 		 552 aa  742    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  61.4 
 
 		 546 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  87.93 
 
 		 563 aa  1026    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  62.32 
 
 		 549 aa  705    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02073  urocanate hydratase  76.33 
 
 		 565 aa  858    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  76.65 
 
 		 556 aa  858    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  89.91 
 
 		 593 aa  1045    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>