More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4895 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.06 
 
 
647 aa  1234    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
739 aa  1481    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.64 
 
 
647 aa  1072    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.31 
 
 
647 aa  1028    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  50.99 
 
 
647 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.23 
 
 
647 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
638 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 
638 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.24 
 
 
638 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.24 
 
 
638 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  43.19 
 
 
633 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  46.06 
 
 
638 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
619 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
638 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
640 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  42.61 
 
 
629 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
638 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
639 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  44.26 
 
 
640 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 
639 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
639 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.34 
 
 
647 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 
639 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
639 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.51 
 
 
642 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
639 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  44.65 
 
 
647 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
642 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
626 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.99 
 
 
676 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 
681 aa  340  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.18 
 
 
650 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 
634 aa  330  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  52.14 
 
 
654 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  54.26 
 
 
652 aa  310  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.6 
 
 
285 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.81 
 
 
655 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 
632 aa  268  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 
544 aa  260  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
646 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 
646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  43.39 
 
 
712 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
541 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  43.48 
 
 
712 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
541 aa  251  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
637 aa  251  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 
541 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
425 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
522 aa  250  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 
541 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  42.17 
 
 
541 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
638 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
541 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
713 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  43.58 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 
624 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
540 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 
674 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  44.64 
 
 
541 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
646 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  44.93 
 
 
541 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
679 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 
636 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
541 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
555 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.45 
 
 
523 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
542 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
541 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 
541 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  37.33 
 
 
541 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
570 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
541 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  42.9 
 
 
546 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
541 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  43.73 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
541 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 
546 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.98 
 
 
546 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
640 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
541 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
548 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 
637 aa  233  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
541 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  41 
 
 
541 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
541 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
541 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
541 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
541 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
542 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
541 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
546 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  42.17 
 
 
575 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
541 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 
543 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>