41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4787 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  99.6 
 
 
251 aa  506  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  93.64 
 
 
236 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  94.86 
 
 
214 aa  406  1e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  71.73 
 
 
232 aa  352  3e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  72.03 
 
 
231 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  72.27 
 
 
237 aa  340  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  53.2 
 
 
241 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  48.52 
 
 
236 aa  221  1e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  48.52 
 
 
236 aa  220  2e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  50.82 
 
 
242 aa  211  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  31.91 
 
 
197 aa  65.9  6e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.86 
 
 
204 aa  65.5  8e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  27.55 
 
 
201 aa  63.9  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  28.11 
 
 
204 aa  58.9  7e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25 
 
 
198 aa  58.5  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.87 
 
 
203 aa  57.4  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  28.64 
 
 
195 aa  54.7  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.11 
 
 
212 aa  54.3  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  27.86 
 
 
197 aa  53.5  3e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  26.09 
 
 
192 aa  52.4  8e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  52  9e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.71 
 
 
211 aa  50.8  2e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  28.37 
 
 
200 aa  51.2  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  26.18 
 
 
208 aa  50.8  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.69 
 
 
209 aa  49.7  5e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  49.3  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  25.53 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.82 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  29.03 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  30.48 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  21.43 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  27.69 
 
 
201 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  27.56 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.16 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  22.56 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.3 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.64 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  24.44 
 
 
199 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>