More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4785 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  99.5 
 
 		 415 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  98.51 
 
 		 404 aa  786    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 404 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  93.56 
 
 		 404 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  77.17 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  77.17 
 
 		 429 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  76.67 
 
 		 418 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  76.67 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  76.43 
 
 		 404 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  76.18 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  72.07 
 
 		 404 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  61.6 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  60.95 
 
 		 410 aa  494  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  55.47 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 406 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  53.85 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  57.11 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  54.39 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  56.36 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  56.36 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  54.07 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  56.36 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  53.6 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  52.36 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  52.38 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  50.38 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  52 
 
 		 398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  49.25 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.71 
 
 		 398 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.25 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.61 
 
 		 406 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.36 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  41.5 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40.74 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.35 
 
 		 420 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  42.14 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  40.86 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  38.38 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  40.99 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.22 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  41.06 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 		 410 aa  242  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  57.48 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  56.46 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  56.46 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.26 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.5 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  40.76 
 
 		 380 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  41.78 
 
 		 303 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  40.9 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48.51 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.81 
 
 		 302 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  49.15 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  48.63 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.47 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  50.42 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  50.42 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  48.73 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  50.44 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.67 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.67 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  46.61 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 		 325 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.12 
 
 		 285 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 		 281 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  52.91 
 
 		 223 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  45.95 
 
 		 281 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  43.25 
 
 		 316 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  43.25 
 
 		 316 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  45.56 
 
 		 281 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.22 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 		 284 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  44.21 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>