More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4780 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  99.13 
 
 
346 aa  703    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
346 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  90.57 
 
 
350 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  85.26 
 
 
339 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  70.9 
 
 
349 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  72.25 
 
 
341 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  76.85 
 
 
355 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  70.23 
 
 
329 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  70.59 
 
 
347 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  70.45 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  53.24 
 
 
319 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  50.51 
 
 
290 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  47.31 
 
 
320 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  46.94 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  46.42 
 
 
319 aa  260  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  48.44 
 
 
377 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  43.69 
 
 
320 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  43.83 
 
 
308 aa  252  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  46.13 
 
 
376 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  45.96 
 
 
377 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  44.29 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  43.66 
 
 
451 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  45.64 
 
 
318 aa  242  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  42.57 
 
 
340 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  42.57 
 
 
340 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  44.98 
 
 
369 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
345 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  42.57 
 
 
340 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  43.66 
 
 
421 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  43.66 
 
 
433 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  42.11 
 
 
344 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  44.75 
 
 
312 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 
335 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  44.08 
 
 
338 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
339 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  44.1 
 
 
325 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
339 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
339 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
339 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 
313 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  44.26 
 
 
313 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  44.25 
 
 
338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  44.41 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  40.72 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  43.01 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  40.95 
 
 
308 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  42.26 
 
 
314 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
285 aa  232  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  42.36 
 
 
358 aa  230  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.17 
 
 
327 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  44.24 
 
 
306 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  43.32 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  40 
 
 
309 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  46.72 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  48.86 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  43.21 
 
 
312 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  41.12 
 
 
325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 
350 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  40.06 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  45.99 
 
 
315 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
312 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  45.99 
 
 
315 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  38.26 
 
 
296 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 
346 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  42.39 
 
 
301 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  38.8 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
327 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.36 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  40.46 
 
 
329 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  42.71 
 
 
330 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
298 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
305 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  37.14 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  34.92 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  37.87 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.9 
 
 
264 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  43.81 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  43.81 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  35.51 
 
 
307 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  35.38 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  33.45 
 
 
336 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  34.24 
 
 
330 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  33.66 
 
 
330 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 
306 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  33.68 
 
 
300 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  33.9 
 
 
303 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>