More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4775 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 307 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  95.77 
 
 		 307 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 286 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  93.01 
 
 		 286 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.32 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  69.2 
 
 		 499 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  65.32 
 
 		 502 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  59.6 
 
 		 496 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  62.29 
 
 		 496 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  70.68 
 
 		 502 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  65.54 
 
 		 500 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  50.34 
 
 		 498 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.18 
 
 		 496 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  53.82 
 
 		 496 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  50.38 
 
 		 488 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  50.38 
 
 		 486 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  45.59 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  45.22 
 
 		 504 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  47.94 
 
 		 510 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  45.59 
 
 		 504 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  47.06 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.95 
 
 		 492 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  46.62 
 
 		 514 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  47.92 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  46.38 
 
 		 494 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  45.42 
 
 		 508 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.33 
 
 		 490 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  50 
 
 		 495 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  45 
 
 		 510 aa  208  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  44.91 
 
 		 503 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  45 
 
 		 510 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  45 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  45 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  45 
 
 		 510 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.74 
 
 		 492 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  45 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  45 
 
 		 515 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  45 
 
 		 515 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  44.62 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  44.62 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  44.62 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  44.62 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  44.62 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.01 
 
 		 494 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.32 
 
 		 494 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.01 
 
 		 494 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.01 
 
 		 494 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  42.61 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  44.09 
 
 		 493 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  45.38 
 
 		 493 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.32 
 
 		 499 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.25 
 
 		 494 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.53 
 
 		 499 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.25 
 
 		 499 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  46.74 
 
 		 496 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  44.26 
 
 		 492 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  42.57 
 
 		 492 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.02 
 
 		 520 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.42 
 
 		 499 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.2 
 
 		 488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  53.21 
 
 		 496 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.24 
 
 		 499 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  43.85 
 
 		 490 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45 
 
 		 502 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.11 
 
 		 509 aa  191  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  42.47 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  46.58 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.27 
 
 		 504 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  42.29 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  42.35 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  42.01 
 
 		 512 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  41.01 
 
 		 513 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.85 
 
 		 529 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  48.1 
 
 		 482 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.91 
 
 		 515 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.57 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  32.65 
 
 		 499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  36.33 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  35.83 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.4 
 
 		 520 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  32.95 
 
 		 499 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.33 
 
 		 521 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  42.76 
 
 		 533 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.28 
 
 		 525 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  37.25 
 
 		 517 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 		 521 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.1 
 
 		 509 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  39.53 
 
 		 506 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.21 
 
 		 524 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.2 
 
 		 493 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.86 
 
 		 512 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.96 
 
 		 511 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.07 
 
 		 533 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.8 
 
 		 513 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.42 
 
 		 530 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.04 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.77 
 
 		 518 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>